960 x 350_41

微卫星不稳定性 (MSI) 分析

MSI 分析利用多重测定、荧光 PCR 和毛细管电泳,以灵敏检测五个单核苷酸重复标记物

微卫星不稳定性(MSI)是由于在缺陷错配修复(MMR)系统的肿瘤细胞中 DNA 复制期间重复单元插入或删除的累积。MSI 状态与某些免疫检查点抑制剂的反应/耐药性相关。Q2 Solutions 的 MSI 测定利用多重检测、荧光 PCR 和毛细管电泳灵敏检测肿瘤 FFPE 样本中五个单核苷酸重复标记物(BAT-25、BAT-26、NR-21、NR-24 和 MONO-27)1。两个或多个单核苷酸位点处的微卫星不稳定性被解释为 MSI-高;单个单核苷酸位点处的微卫星不稳定性被解释为 MSI-低;所测试的任何这些位点,没有被解释为微卫星稳定(MSS)的不稳定性。

显示 MSI 高状态的结肠癌 FFPE 组织样本示例
genomics-msi-1
示例性毛细管电泳图,显示正常组织(上图)中的参考正常特征以及肿瘤 FFPE 组织(下图)中的 MSI-高特征。在肿瘤组织中检测到标记为 1−5 的新 MSI 事件。

 

MSI 分析规格
标志物 BAT-25、BAT-26、MONO-27、NR-21 和 NR-24 微卫星位点
样本要求 肿瘤:3 x 5um FFPE 肿瘤组织切片或 3 个卷曲或 FFPE 蜡块或 DNA。需要最少 20% 的肿瘤细胞。正常:全血(1-3 mL,K2EDTA)或肿瘤 FFPE 切片,清楚指明正常组织区域或 3 x 5um 正常组织 FFPE 玻片、卷曲或组织块。如果没有指示肿瘤正常区域的 H&E 染色玻片,则将进行 染色评估并确定样本的充分性。
测定方法 MSI 分析系统(Promega)2
系统兼容性 Thermo Fisher Scientific SeqStudio
监管层 仅供研究使用 (RUO)、药物临床试验质量管理规范 (GCP),咨询 CLIA 可用性
可交付成果 MSI 状态报告。可用作自定义报告的 MSI 标志物的精确数量。


1Boland 等人 Cancer Res. 1998;58:5248-5257. 2 Promega MSI 测定也可在 Q² Solutions 中国北京实验室设施获得。

相关思想领袖见解


Ensemble-based method for detecting differential expression in RNA datasets provides greater sensitivity and less biased p-values than existing methods

In examining two-group differential analysis, it is apparent that different statistical methods can yield very different results even given the same RNA-Seq input data. In particular, we have...

Assay development, validation, and manufacturing with built-in quality controls

With more than 25 years of experience, Rules-Based Medicine, a Q2 Solutions company develops, validates and manufactures its assays with integrity and commitment for the most reliable, reproducible...

Unleashing the power of MHC Associated Peptide Proteomics: Immunogenicity Assessment of Oncology Drugs

By Chloe Ackaert, Jana Schockaert, Aurelie Mazy, Martijn Vlaming, and Sofie PattynPresented at the American Association for Cancer Research (AACR) Annual Meeting, April 5-10, 2024 Bispecifics...