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单细胞 RNA 测序

通过探索细胞异质性、跟踪群体变化和发现分子相互作用来加速研究

10x 认证服务提供商

发现细胞多样性,以推动临床和转化研究

单细胞测序是一种下一代测序方法,可通过揭示单细胞分辨率下的遗传表达来深入表征生物分子。它在检测罕见细胞类型、发现肿瘤异质性、痕量谱系、发现耐药细胞群以及表征外周血免疫细胞等复杂细胞群方面优于常规批量测序。Q2 利用领先的技术,如 10x Genomics® Chromium™ 和 Illumina® NovaSeq™ 系统平台。我们可结合我们的全球实验室网络和专家支持团队,提供涵盖临床研究连续体的广泛服务,满足您的测序需求。

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高质量、高通量、高满意度

 

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可定制单细胞测序解决方案,以满足您的研究需求


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单细胞 RNA 测序

使用我们的单细胞 RNA 测序测定,每个样本可测定多达 10,000 个细胞。我们的测定使用 Chromium Controller™ 微流控芯片平台提供 3ʹ 或 5' 技术数字基因表达。将冻存样本解冻并制备成单细胞悬液,然后载入 Chromium Controller™。

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单细胞免疫库 – T 细胞受体(TCR)和 B 细胞受体(BCR)谱分析

使用我们的免疫库测定,从单细胞处理中收集更多的信息。靶向全长配对 T 细胞受体或 B 细胞免疫球蛋白(Ig)转录本,包括同种型和 T 细胞受体 α/β。

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单细胞表面蛋白谱分析

纳入细胞表面蛋白检测和抗原特异性分析,结合我们的表面蛋白谱分析基因表达和免疫库谱分析。

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单核 RNA 测序

使用我们的单核测定法检测难以分离的细胞类型并发现复杂的异质性。使用新鲜冷冻组织,通过避开传统解离诱导的转录变化,如实捕获 RNA 表达。

支持全球研究

我们集中化的科学运营监督与我们的全球实验室布局相结合,可提供全面、大规模的试验支持。从您的临床研究医院到我们的一个中心实验室之间的快速交付,对于保持样本的完整性至关重要。我们可以在 24-48 小时内从世界上几乎任何地方运输样本。

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简化您的工作

Simplify Your Work
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Ship Your Samples

Our global central laboratory network enables testing at a single site.

Get Your Results

Obtain in-depth data to understand gene expression, cell surface markers, immune cell repertoire, and much more.

您可以信赖的技术

我们的测定方法将单个细胞分配至纳升凝胶珠中进行逆转录并打上细胞条形码,然后进行样本库制备和测序,从而获得单细胞分辨率。我们经验证的样本处理程序可确保可靠的监管链。

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样本制备和评估

我们使用冷冻 PBMC 自动化温控解冻法谨慎地解冻您的样本,降低了操作员差异、过度解冻和污染的风险。我们还利用高通量、自动细胞计数和层流式细胞清洗方案减少差异,提高保留率和活力。

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构建样本库

每个细胞被分配至纳米升级凝胶微球乳化液(GEM)中,并打上了独特的条形码,允许对单个细胞进行标记和谱分析。多个样本库可由单个样本构建,生成可链接回同一单细胞的多个读数。

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测序

在 Illumina® NovaSeq™ 对制备好的样本库可以进行测序,以便对每个细胞进行高通量、快速和深度测序。

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生物信息学分析和交付

稳健的计算架构、成熟的标准分析渠道和专门的生物信息学家团队能够快速分析样本。应要求,经验丰富的数据分析团队可就您的研究目标提供咨询,并深入探索项目数据。

常见问题

什么是单细胞测序?
单细胞测序是一种下一代测序方法,涉及单细胞分离、转录组表征和测序样本库生成。单细胞测序通过揭示样本中的细胞基因表达、数量和多样性,以高分辨率揭示异质性。
与传统方法相比,单细胞测序有什么优势?
单细胞测序与传统批量测序、定量聚合酶链式反应(qPCR)和流式细胞术方法的主要差异在于,单细胞测序允许通过在单细胞分辨率下分析整个转录组来表征异质性样本。我们的 96 倍通量样本库制备能力是传统方法的 12 倍。单细胞通常与传统方法结合使用,以获得对样本的全面了解。
您采取了哪些控制措施来限制差异?
我们在工作流程中使用各种自动化方法,以减少差异。我们自动进行温控解冻,以取代手动水浴,高通量细胞计数,以获得客观存活率和计数百分比,以及层流式细胞清洗,以减少传统离心方法的操作和应力。此外,我们去除了死细胞,如果未去除,会导致结果不完全和测序目标缺失。
实验结束时,我会收到哪些数据?
核心可交付成果
每份样本文件
  • FASTQ
  • BAM
  • 10x HTML QC
  • 群集 CSV 表示每个细胞的群集
  • 对应每个群集 CSV 的差异表达 CSV
  • 主要成分分析 CSV
  • 每个细胞格坐标的 tSNE 预测 CSV
  • 原始和过滤特征条形码矩阵,包含细胞 UMI 计数和基因注释文件(H5 和 MTX)
  • 在 Loupe 浏览器中用于可视化和分析的 cloupe 文件
  • 压缩的 h5 文件用于不同的分析程序
  • 表格包含每个细胞条形码的一条记录,用于预测死细胞状态、多重状态
批次文件
  • 基因组学网络总结报告:包含使用 SingleR 注释的测序、比对、估计细胞、死细胞、多重分析和人细胞类型频率总结(探索性)
TCR/BCR 数据文件
  • 重链和轻链型(BCR)
  • 成对克隆型(TCR)
  • 结合和共识序列
  • 指标总结
我是否可以定制测定以符合我的特定研究需求?
可以!我们知道,没有两个研究项目是完全相同的。我们与您合作以了解您的特定研究需求,我们的团队提供具有成本效益的建议,以实现您的目标。请立即联系我们的团队,了解有关定制测定开发和专业生物信息学支持的更多信息。
我在哪里可以找到其他常见问题的答案?
您可在我们的通用基因组学常见问题解答网页上找到其他答案。

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