全面了解您样本中的基因组改变,对于了解您的受关注感兴趣疾病至关重要。Q2 Solutions 有多种解决方案,可帮助您最大限度地利用数据的完整价值。
解决方案 |
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SNP 和 Indels – 胚系、肿瘤-正常、仅肿瘤* |
拷贝数变化 – 胚系、体细胞 |
结构变体 |
TMB |
新抗原 |
融合 |
RNA SNP 和 Indels – 胚系和体细胞* |
RNA TMB* |
计划 | TP | FP | 灵敏度 |
STAR-SEQR(v0.6.3) | 49 | 0 | 98% |
Pizzly(v0.37.3) | 45 | 2 | 90% |
STAR-Fusion(v.0.8.0) | 44 | 1 | 90% |
JAFFA(v1.07) | 43 | 0 | 86% |
MapSplice(v2.2.1) | 42 | 1 | 84% |
FusionMap(2015-3-31) | 36 | 0 | 72% |
defuse(v0.6.2) | 35 | 1 | 70% |
FusionCatcher(v0.99.6a) | 31 | 0 | 62% |
STAR+OncoFuse(v1.07) | 31 | 0 | 62% |
Tophat-Fusion(v2.0.14) | 28 | 1 | 56% |
FusionHunter(v1.4) | 20 | 6 | 40% |
EricScript(v0.0.5) | 39 | 0 | 78% |
凭借拥有近十年的 NGS 经验,Q2 Solutions 已经开发了用于数据准确识别和定量的工具和程序。
解决方案 |
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基因和异构体定量 |
两组比较 |
B 细胞和 T 细胞库 |
IgHV 鉴定 |
HLA 分型 |
16S 微生物测序 |
流感毒株鉴别 |
Q2 Solutions 拥有广泛的定制分析经验,包括标准途径和基因集富集分析,直至生物标志物发现。
解决方案 |
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生物标志物发现 |
RNA 标记识别和解释 |
基于 DNA 的标记和识别 |
免疫格局/肿瘤微环境标记 |
基因集富集分析 |
路径分析 |
With over 500 years cumulative expertise in genomics, bioinformatics, and information technologies, we provide infrastructure and consultative services to enable you with the fastest path from sample...
Author:Wendell Jones, Ph.D., Principal Bioinformaticist and Scientific Advisor, Q2 SolutionsBioinformatics is a cross-disciplinary area that requires skills or knowledge in molecular biology,...